日本留学签证可以在中国的日本领事馆或者大使馆申请，具体需要申请哪个机构可以根据你所在的居住地或就读学校的账户来选择，一般建议选择最靠近你的地址的机构提交申请。
目前，在中国大陆的首都北京，设有日本大使馆和日本驻华大使馆经济处，因此，在北京留学的学生可以前往日本大使馆或经济处提交签证申请。在上海，日本领事馆上海总领事馆提供签证服务；在广州，日本驻广州总领事馆也提供签证服务。
需要注意的是，日本留学签证不是简单的申请，需要提供学历、资金、语言成绩等多项材料，因此在申请前一定要做好充分的准备和咨询，确保材料完备，以免因为申请材料不足或不符合条件而被拒签。
在提交申请材料之前，还需要通过日本大使馆或领事馆网站上的在线预约系统预约面谈时间。面谈时间需要提前预约，而日本使馆和领事馆的预约名额相对较少，并且会出现比较严重的等待情况，因此申请人需要提前预约，并且提前准备材料，以免错过申请时间。
此外，日本留学签证的申请费用也是需要注意的，不同的签证类型价格也会有所不同。一般来说，日本留学签证的申请费用在500元人民币左右，但是如果需要加急处理，费用也会相应地增加。
总的来说，如果你打算留学日本，就需要先选择合适的签证类型，然后到所在地的日本大使馆或领事馆提交申请，并且一定要提前准备好所有申请所需的材料和费用。只有准备充分并且通过了面谈和材料审核，才能顺利申请到日本留学签证，顺利实现自己的留学梦想。
