关于日本留学签证是否会查梅毒的问题，其实并没有一个统一的答案，因为不同的情况会考虑到不同的因素，所以一般都是以具体情况而定。
首先，针对长期留学及工作签证，日本政府会要求申请人进行健康检查。具体的检查内容包括身高、体重、血压等常规体检以及肺结核、肝炎等传染病的筛查。而梅毒在日本国内并不是一种常见的传染病，所以在一般情况下是不会进行检查的。
其次，如果申请人在日本国内需要进行医疗方面的工作或学习，那么日本政府就可能会要求进行更为严格的健康检查，并且其中就包括梅毒。这是因为在日本国内，每一个医学专业的从业者都需要接受医学教育，其中也包括有关各种疾病的诊断和治疗。因此，对于会有接触患者或患有某些特定疾病的申请人，在日本进行更加详细的身体检查就显得尤为重要，以保障其在未来进行医疗活动的安全性。
此外，留学申请人在申请签证时必须提交的所有个人基本信息，包括个人身体状况等都会被日本政府的相关机构核实，以便进行背景调查。如果被发现有相关疾病或任何不良记录，申请人就有可能会被拒签。但是，如果你身体状况良好，没有任何疾病或不良记录，一般情况下是不需要太担心。
总的来说，关于日本留学签证是否会查梅毒，答案并不确定。根据具体情况而定，如果你的申请需要进行医疗方面的工作或学习，或者申请人在个人基本信息核实时被发现有相关疾病或不良记录，就有可能会导致签证被拒签。因此，留学申请人应该保持身体健康，并在申请签证前注意自身基本信息的真实性和正确性，以免因为个人基本信息有误或缺失而影响签证的顺利申请。
