博士日本公派留学的费用相对较高，但也并非不可承受。以下是主要费用分析：
1.学费：日本博士公费留学生每年的学费是很便宜，数额最高的也不会超过10万元人民币，一般为5-7万元人民币之间。
2.生活费：日本的生活费相对较高，主要体现在食品、住宿及生活用品等方面，根据不同的生活水平，每天的生活费大概在150-250元左右，每月生活费用一般在5000-8000元之间。
3.机票：机票价格因为时间、起降点不同而变化较大，一般来说，从中国到日本需要10000元左右，留学生在学习期间需要回国也需要相应价位的往返机票费用。
4.签证材料费：公费留学生每次签证时都需要支付一定的签证费用，以及制作签证所需的照片、文件复印等费用，根据不同情况可能在1000元左右。
5.医疗保险费：日本的医疗保险制度为每个人提供了安全保障，但公费留学生在留学期间也需要购买相应的医疗保险，一般每年在3万左右。
6.其他费用：包括物品购置费、文化活动费、旅游费等，根据不同的需要而定，一般每月需要1000-2000元。
综上所述，博士日本公派留学费用并不便宜，一般需要30-40万的投入，但是相比于其他国家的留学费用，日本略显便宜。公费留学生还可以享受学校补贴性质的津贴，减缓留学压力。对于经济状况较为拮据的留学生可以申请日本各类奖学金和贷款，减轻不必要的经济负担。同时，留学过程中还可以通过打工和教学助理等方式获取一定的补贴和经验。
