根据日本留学签证的相关政策和规定，被拒签并不会影响学生已支付的学费。因此，一般情况下，日本留学签证被拒后，学费是不会退还的。
然而，在一些特殊情况下，学生可能可以获得部分或全部退款。例如，如果学生在申请签证时提供的材料存在错误或不完整，导致签证被拒，而这些错误或不完整的信息是由学校或代理机构提供的，那么学校或代理机构可能会对学生支付的学费进行退款。
此外，如果学生遇到了紧急情况，不能按计划前往日本留学，例如因为疾病或家庭紧急情况等不可抗力因素，学校或代理机构也可能会根据特定政策，对学生支付的学费进行退款。
另外，根据日本的法律和规定，所有留学生都需要在入学前支付一定的学费和其他费用，这些费用是非常规定的，只有在特殊情况下才能够退款。因此，学生在申请日本留学前，应该充分了解学费退款的政策和规定，并选择一个信誉良好的学校或代理机构。
总的来说，日本留学签证被拒后，学费是不会被退还的。但是，在特殊情况下，学生可能会获得部分或全部退款。因此，学生在申请日本留学前应该仔细了解学费退款的政策和规定，以避免不必要的损失。
