在日本留学三年的学费费用因地区、学校、专业及住宿方式等因素会有所不同。但是可以根据近年的经验及数据来推论，大概需要的费用如下：
1、学费：在日本大部分学校，本科学费每年约为72万日元（不含入学费、教材费等）。所以，三年的学费大概需要216万日元。
2、生活费：在东京或大阪等大城市，生活费用较高。在学校内食堂用餐，每日大约需要1500日元；宿舍或学生公寓住宿每月需50000日元左右；交通费用方面，JR通勤每月约为22000日元。其他日用品费用，也需考虑进去。因此三年的生活费大约需要300万日元。
3、医疗保险：在日本居住超过一年的外国人必须加入全民健康保险。根据个人情况不同，保险费用差别较大，平均每月需4000-6000日元左右，三年的费用大概需要86万日元。
4、签证费用：根据签证类别不同，费用也不同。普通签证(留学类别)的费用大约为6000日元。
5、语言学习费用：如果在日本进行语言学习，费用大概需要16-25万日元。
综合上述几个方面来看，三年在日本留学的总费用至少在600万日元以上，如果在大城市生活或者读取研究生等较高学历，费用会更高。所以，在规划留学计划时，应当认真考虑自己及家庭财务状况，做好详细的预算和规划。
