如果持有日本留学签证的女性怀孕了，建议及时跟留学生签证所属机构联系，了解日本留学签证政策及医疗保险政策等方面的具体情况。
首先，日本留学签证的有效期限是由入境到期日算起一个学期或一年的时间，持签证人需要按照时间规定内离境或进行签证延期。如果怀孕期间签证有效期将到期，建议提前一个月到日本移民局办理签证延期手续。申请延期手续需要在指定时间内提交相关材料。
其次，在日本怀孕期间，持签证人需要及时了解医疗保险政策，以及了解社保和医疗保险的具体情况。在日本，有“国民健康保险”、“厚生年金”、“劳动保险”、“人寿保险”等不同类型的保险，对不同的人群有不同的适用范围和优惠政策。持签证人可以向留学生签证所属机构咨询相关问题，或者到当地的国民健康保险部门、医疗保险部门等机构咨询具体问题。
此外，持签证人还需要了解日本相关的孕产假政策。在日本，孕妇有权利在怀孕前的6个月内取得产假，在孕期结束时，可以从生育健康保险中获得相关的休假和补偿。持签证人可以向留学生签证所属机构咨询相关问题，或者到当地的社保和劳保等机构咨询具体问题。
最后，如果持签证人在怀孕期间需要离开日本，建议跟签证所属机构沟通，了解日本出入境管制政策和相关的移民手续。如果需要在怀孕期间离开日本，持签证人需要及时办理必要的手续，提前准备好相关的文件和证明材料，并向日本移民局申请相关的审批。
总之，在日本怀孕期间，持签证人需要及时了解签证政策、医疗保险政策和社保政策等政策，积极沟通并办理必要的手续，以确保怀孕期间的安全和福利。如有任何问题，也可以随时向留学生签证所属机构或者相关机构咨询。
