日本留学自费三年的费用因人而异，因为在日本生活的同时，每个人的消费水平、生活习惯、学校所在地等因素都会对费用造成影响。然而，我们可以根据一些参考值，对这个问题进行一些预估和分析。
首先，日本留学需要缴纳的费用主要有以下几项：
1.学费：学费是日本留学最主要的开销之一。因为不同的课程、学校和学位的学费也会有一定的差异。大多数的本科生每年需要缴纳大约10万至20万元不等的学费。而硕士研究生或博士研究生的学费则会更高。
2.生活费：在日本生活水平较高，留学生活费用也较高。日本的生活费用包括食宿、交通、水电燃料、通讯等费用，每个人的花费差异也比较大，但是留学生需要根据自身情况自行评估。在日本，留学生每个月的生活费大约需要在5～10万元之间，可以根据自己的需求调整。
3.保险费：留学生在日本需要购买健康保险。保险费因保险公司和保险方案而异，费用在每年7万以内，具体费用可以咨询当地保险公司。
4.签证费用：留学生需要缴纳签证费用，具体费用因国籍而异，在7000元左右。
这些费用不包括往返机票、学杂费、文具用品等其他费用。预估日本留学自费三年的费用的参考值如下：
学费：300，000-600，000元左右（根据不同学校、专业以及学位）
生活费：180，000-360，000元左右，不含住宿
住宿费：约为每月3万-6万元左右
保险费：每年约为7万以内
签证费：约为7000元左右
机票：每次约为3000-6000元左右
学杂费、文具用品等其他费用：约为每年3，000-6，000元左右
综上，留学生需要准备的费用至少应该在60万-120万元之间。当然，具体情况还需要综合考虑，如个人生活费水平、所在城市房价、季节性花费等等。同时，还可以适当控制自己的开销，在学习生活中适当控制消费，避免过度消费造成财务困难。
总之，日本留学需要的费用不低，如果没有足够的家庭支持，就需要自己做好经济规划和独立支配财务的意识，这样才能做好留学生涯的规划，更好地享受留学带来的学习和生活。
