南京日本留学需要多少钱取决于诸多因素，包括申请期间需要支付的费用、日本学校的学费和生活费、签证费用以及其他与留学相关的费用。 下面是一些具体的费用细节：
1. 报名费和申请费：
在申请日本留学时，需要支付一定的报名费和申请费用。 具体费用根据院校和项目的不同而异，平均约为4000-8000人民币。
2. 日本大学学费和住宿费：
日本大学学费和住宿费是南京留学生最主要的费用。 大学学费通常每年在20万-30万人民币之间，与课程和学校的级别有关。另外，学生还需要支付住宿费用，通常为70000-100000人民币/年。
3. 生活费：
留学生的日常生活费用包括食品、住房、交通、通信、娱乐和其他支出等，也是留学过程中需要考虑的重要费用。 日本生活费用较高，平均每月需要4000-8000人民币左右。
4. 购买日本留学生保险：
根据日本的法律规定，在日本留学的外国学生需要购买日本留学生保险。保费根据保险公司和申请人的具体情况而定，平均每年在3000-5000人民币左右。
5. 签证费用：
如果您持有中国护照，需要在前往日本之前申请日本签证。 日本签证费用以及申请程序可能会有所不同，但通常在500-1000人民币之间。
6. 其他费用：
此外，还需要考虑杂项费用，如语言培训、教材、旅行、购物和其他额外的支出。 所有这些额外支出都取决于申请人个人要求和购买力等因素，并且可能会根据留学生的计划和时间表而不同。
综上所述，日本留学费用并不低，需要考虑到包括学费、生活费用、签证费用在内的各种预算事项，申请者需要仔细规划和准备自己的财务计划。
