首先需要明确的是，日本留学费用与国家大多数大学教育费用相比仍然较高。综合考虑住宿、饮食、交通、保险、学费和生活费等因素，每年的预算大约在100万日元（约合人民币6.46万元）以上。当然，最终费用还要考虑具体留学地点、留学期限等因素。
那么，为什么日本留学费用这么高呢？
1. 高昂的住宿费用
日本的住宿费用普遍较高。许多留学生选择在校内或周边租房居住，房租可能占据留学生消费金额的较大比重。
2. 饮食费用相对较高
日本的饮食文化是一个重要的消费部分。由于日本的物价水平较高，购买一些基本的食品（大米、水果、鱼类等）价格也都相对较贵，加之日本有较高的消费税，从而使得饮食费用成为留学费用的一大部分。
3. 高昂的医疗保险费用
日本的医疗保健系统很完善，但是留学生需要单独购买保险，其费用较高，成为留学费用的一项重要开支。
4. 高昂的学费和教材费用
日本大部分高等教育机构的学费比较高，而且教材费用较贵。虽然一些机构会提供奖学金等资助，但是相比其他国家来说仍高于平均水平。
此外，通过留学机构来申请可能会增加留学费用，但是可以为留学生提供更多的便利和保障。不过，留学费用高并不应该成为留学的绊脚石。留学生可以通过一些方式减少费用，例如选择较为便宜的住宿、做饭等等。此外，也可以尝试申请各种奖学金和助学金等资助。
总之，日本留学费用的确较高，但是如果留学生能够做好预算和规划，选择合适的留学机构和生活方式，还是可以在留学中取得成功。
