日本留学签证进度的查询方式因人而异，具体可以分为以下几种情况：
1. 通过申请机构查询
如果您是通过申请机构（如日本留学中介）处理申请的，可以向他们查询签证进度。一般情况下，他们会在申请过程中向您提供一个申请账号，通过这个账号可以查询申请资料、申请进度等等。
2. 通过日本大使馆查询
如果您是自己前往日本大使馆办理签证的，可以通过以下几种方式查询签证进度：
（1）拨打日本大使馆签证办理中心的电话号码：010-6532-4910；
（2）通过日本大使馆官方网站查询。（https://www.cn.emb-japan.go.jp/visa/status_check.html）
需要注意的是，查询签证进度时需要输入申请人的护照号码、生日等个人信息。此外，查询签证进度的时间会受到申请人数的影响，如遇到节假日、周末等情况，可能会造成查询结果更新延迟。
3. 通过短信服务查询
有些日本留学中介还提供签证办理进度短信通知服务，申请人只需要将手机号码告诉中介即可。一旦签证进度发生更新，中介会通过短信通知申请人。
总之，不管通过哪种方式查询签证进度，建议申请人保持耐心，尤其是在繁忙的旅游、学习季节，签证办理时间可能会较长。如有紧急情况，可以直接联系日本大使馆询问签证情况。
